Une maladie émergente se définit comme une infection nouvelle, causée par l'évolution ou la modification d'un agent pathogène ou d'un parasite existant, qui se traduit par un changement d'hôtes, de vecteur, de pathogénicité ou de souche. Le terme s'applique aussi à l'apparition d'une infection ou d'une maladie non encore signalée. On parle de maladie ré-émergente lorsqu'une maladie connue fait irruption dans un nouveau contexte géographique, élargit sa gamme d'hôtes ou enregistre une forte progression de sa prévalence (OIE).
Parmi l’ensemble des maladies émergentes, plus de 60% sont des zoonoses (Jones et al., 2008, Nature 451:990-3). Les zoonoses émergentes représentent une menace croissante pour la santé publique au niveau mondial.